Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms