Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r195Q5SVD6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmn1r195Q5SVD6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r195Q5SVD6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms