Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc85aQ5SP85 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc85aQ5SP85 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc85aQ5SP85 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms