Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm11487Q5RIS0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm11487Q5RIS0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm11487Q5RIS0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm11487Q5RIS0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm11487Q5RIS0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm11487Q5RIS0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm11487Q5RIS0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm11487Q5RIS0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm11487Q5RIS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm11487Q5RIS0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11487Q5RIS0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms