Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Mdc1Q5PSV9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mdc1Q5PSV9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Mdc1Q5PSV9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mdc1Q5PSV9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mdc1Q5PSV9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Mdc1Q5PSV9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms