Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Trim41Q5NCC3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Trim41Q5NCC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Trim41Q5NCC3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Trim41Q5NCC3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Trim41Q5NCC3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Trim41Q5NCC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms