Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm12185Q5NCB2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Gm12185Q5NCB2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gm12185Q5NCB2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gm12185Q5NCB2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm12185Q5NCB2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms