Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Usp28Q5I043 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp28Q5I043 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp28Q5I043 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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