Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx49Q4FZF3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ddx49Q4FZF3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ddx49Q4FZF3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx49Q4FZF3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx49Q4FZF3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ddx49Q4FZF3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ddx49Q4FZF3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms