Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxn3Q499D0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxn3Q499D0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Foxn3Q499D0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxn3Q499D0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxn3Q499D0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxn3Q499D0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxn3Q499D0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Foxn3Q499D0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Foxn3Q499D0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Foxn3Q499D0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Foxn3Q499D0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms