Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Carmil2Q3V3V9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Carmil2Q3V3V9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Carmil2Q3V3V9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil2Q3V3V9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms