Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pacs2Q3V3Q7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pacs2Q3V3Q7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pacs2Q3V3Q7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pacs2Q3V3Q7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms