Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K9

Pls1, Plastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls1Q3V0K9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pls1Q3V0K9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pls1Q3V0K9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pls1Q3V0K9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pls1Q3V0K9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms