Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hipk4Q3V016 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hipk4Q3V016 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hipk4Q3V016 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms