Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C87499Q3UX49 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C87499Q3UX49 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C87499Q3UX49 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C87499Q3UX49 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms