Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
E330034G19RikQ3UWX6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E330034G19RikQ3UWX6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E330034G19RikQ3UWX6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
E330034G19RikQ3UWX6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms