Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clpsl2Q3UW21 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clpsl2Q3UW21 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clpsl2Q3UW21 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clpsl2Q3UW21 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clpsl2Q3UW21 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clpsl2Q3UW21 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Clpsl2Q3UW21 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clpsl2Q3UW21 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clpsl2Q3UW21 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Clpsl2Q3UW21 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clpsl2Q3UW21 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms