Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rtl4Q3URY0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtl4Q3URY0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtl4Q3URY0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms