Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrc4Q3UP24 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrc4Q3UP24 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrc4Q3UP24 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms