Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VwceQ3U515 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VwceQ3U515 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VwceQ3U515 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms