Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctu2Q3U308 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ctu2Q3U308 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ctu2Q3U308 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms