Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sec24aQ3U2P1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sec24aQ3U2P1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec24aQ3U2P1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms