Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdkl4Q3TZA2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdkl4Q3TZA2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl4Q3TZA2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms