Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfyve27Q3TXX3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfyve27Q3TXX3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zfyve27Q3TXX3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zfyve27Q3TXX3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms