Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdlim7Q3TJD7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdlim7Q3TJD7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pdlim7Q3TJD7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdlim7Q3TJD7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdlim7Q3TJD7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms