Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prr27Q3SYJ2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prr27Q3SYJ2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms