Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hddc2Q3SXD3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hddc2Q3SXD3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hddc2Q3SXD3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hddc2Q3SXD3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms