Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdss1Q33DR2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdss1Q33DR2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdss1Q33DR2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms