Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Shroom4Q1W617 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Shroom4Q1W617 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Shroom4Q1W617 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Shroom4Q1W617 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Shroom4Q1W617 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
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