Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Traf3ip1Q149C2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Traf3ip1Q149C2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Traf3ip1Q149C2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms