Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Bpifa6Q0VGU8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Bpifa6Q0VGU8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms