Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col19a1Q0VF58 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col19a1Q0VF58 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col19a1Q0VF58 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms