Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zc3h18Q0P678 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zc3h18Q0P678 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zc3h18Q0P678 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zc3h18Q0P678 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms