Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TrioQ0KL02 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TrioQ0KL02 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TrioQ0KL02 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrioQ0KL02 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms