Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pate4Q09098 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pate4Q09098 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms