Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rbp2Q08652 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rbp2Q08652 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rbp2Q08652 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms