Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col9a2Q07643 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col9a2Q07643 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col9a2Q07643 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col9a2Q07643 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms