Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdr16c6Q05A13 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdr16c6Q05A13 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms