Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Fmn1Q05860 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Fmn1Q05860 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Fmn1Q05860 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Fmn1Q05860 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Fmn1Q05860 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Fmn1Q05860 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Fmn1Q05860 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Fmn1Q05860 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Fmn1Q05860 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Fmn1Q05860 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Fmn1Q05860 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Fmn1Q05860 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms