Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pfdn6Q03958 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pfdn6Q03958 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pfdn6Q03958 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms