Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pdcd1Q02242 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pdcd1Q02242 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pdcd1Q02242 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms