Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Apoa1Q00623 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apoa1Q00623 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apoa1Q00623 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.6 ms