Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bop1P97452 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bop1P97452 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bop1P97452 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bop1P97452 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bop1P97452 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bop1P97452 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bop1P97452 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Bop1P97452 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bop1P97452 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bop1P97452 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bop1P97452 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bop1P97452 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bop1P97452 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bop1P97452 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Bop1P97452 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Bop1P97452 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.3 ms