Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps45P97390 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps45P97390 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vps45P97390 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps45P97390 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps45P97390 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps45P97390 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps45P97390 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps45P97390 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps45P97390 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps45P97390 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps45P97390 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms