Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Psme1P97371 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Psme1P97371 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Psme1P97371 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Psme1P97371 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Psme1P97371 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Psme1P97371 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Psme1P97371 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Psme1P97371 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Psme1P97371 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Psme1P97371 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Psme1P97371 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Psme1P97371 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Psme1P97371 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Psme1P97371 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Psme1P97371 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Psme1P97371 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Psme1P97371 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Psme1P97371 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Psme1P97371 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Psme1P97371 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Psme1P97371 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Psme1P97371 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Psme1P97371 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms