Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx1P80205 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx1P80205 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Otx1P80205 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx1P80205 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx1P80205 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx1P80205 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx1P80205 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Otx1P80205 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Otx1P80205 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms