Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Shox2P70390 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shox2P70390 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shox2P70390 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Shox2P70390 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shox2P70390 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shox2P70390 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shox2P70390 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shox2P70390 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shox2P70390 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shox2P70390 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shox2P70390 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms