Protein–RNA interactions for Protein: P70288

Hdac2, Histone deacetylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac2P70288 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hdac2P70288 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hdac2P70288 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hdac2P70288 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms