Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpeP62305 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpeP62305 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms