Protein–RNA interactions for Protein: P60670

Nploc4, Nuclear protein localization protein 4 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nploc4P60670 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nploc4P60670 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nploc4P60670 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nploc4P60670 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nploc4P60670 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nploc4P60670 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nploc4P60670 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nploc4P60670 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nploc4P60670 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nploc4P60670 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nploc4P60670 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nploc4P60670 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nploc4P60670 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nploc4P60670 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nploc4P60670 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nploc4P60670 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms